中央空调系统污染引起的疾病主要有三类：哮喘；军团病；不良建筑物综合征。
1.哮喘
哮喘的临床表现为反复发作的喘息、胸闷、气短、咳嗽等症状。引起此类症状的原因广泛而复杂，变异来源和呼吸道病毒感染是重要原因。灰尘、尘螨、真菌孢子等都可能是变异的来源。这些变异源可能来自沉积在空调系统风管中的灰尘，以及来自冷却塔和加湿器的微生物气溶胶。
2.军团病
军团病是由军团菌引起的呼吸道感染。空调系统的冷却塔非常适合军团菌的生长，人们可能因吸入被军团菌污染的气溶胶而感染。感染后的主要症状有两种基本类型：一种是肺炎（军团菌肺炎），另一种是非肺炎（庞蒂亚克热）。前者感染后临床表现严重，主要表现为肺部感染和全身器官损害；当发生多器官损害时，病死率非常高。后者感染后临床表现较轻，病程较短，但体温恢复正常后仍会出现一些其他症状。目前，没有证据表明军团病 疾病可以在人与人之间传播，并且可能由家用空调引起。大多数感染者都在使用中央空调系统的酒店、医院和办公楼等公共场所。军团病的潜伏期一般为2-10天，最短的为36小时，部分病例长达19天。前期症状为发热、全身乏力、肌痛、头痛等，1天后出现寒战、高烧、咳嗽、胸痛，1周内出现实质性肺炎。症状包括罗音、干咳和咳痰，但很少伴有浓痰。大多数患者在几天的松弛热后逐渐消退，死亡率为15%-20%。大多数感染者都在酒店等公共场所，使用中央空调系统的医院和办公楼。
3.不良建筑物综合征
不良建筑物综合征亦称为病态建筑物综合征，是活动在不良建筑物内的人群产生的一系列自觉症状。这些包括鼻塞或鼻炎、喉咙干燥、头痛、疲劳等。没有任何单一因素会导致症状。但在空调密闭建筑中，空调系统管道积尘、冷凝器水质污染，特别是新风量不足、气流组织不合理，都会增加不利建筑综合症的发生率。
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