目前，我国城市的二次供水方式多为修建地下蓄水池和屋顶蓄水池。虽然部分管网用水量大、水压低的问题得到解决，但二次供水系统受到污染，饮用水水质下降，各种严重的水污染时有发生，这极大地影响人们的健康。人民生活水平的提高与对水质要求越来越高的矛盾日益突出。加强二次供水管理，确保用户用上符合国家水质标准的水，是供水企业必须面对和解决的问题。
饮用水水质安全关系到居民身体健康。因此，为保障饮用水的卫生和安全，国家卫生部门出台了严格的规定，加强对饮用水水质的监测和管理。各项法律法规对各类供水设施特别是二次供水设施的水质采样点位置、检验项目和检验频次等均有明确要求。
二次供水中存在的水质问题主要有：
1、红虫、细菌等微生物
水箱（池）内的水长期积水，积累了各种有机物，为红虫、细菌等微生物的繁殖提供了物质基础；池水停留一段时间，对流小，使水中氧气不足。适宜的温度有利于红虫、细菌等微生物的生长繁殖；远离水厂的水池中余氯的减少，为红虫、细菌等微生物的生存提供了条件。这些生物常寄生在水箱的积泥、粗水箱（池）表面、水管内的水垢、藻类中。
2、浊度和颜色
二次供水的浊度和色度明显高于管网水和厂区用水，这是二次供水设施（水池、供水管道）二次污染造成的。
3、氨氮等有机物
调查显示，管网水和二次供水氨氮含量分别为0.02mg/L和0.07mg/L，二次供水氨氮含量明显高于市政用水；偏高。
二次供水设施清洗消毒时，过量使用含氯消毒剂，易造成氯仿、四氯化碳等氯消毒副产物超标。
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